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澳研究人員用基因測序“修正”細(xì)菌分類
2018-08-29 09:32:57 來源: 新華網(wǎng)
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  新華社悉尼8月29日電(陳宇)澳大利亞昆士蘭大學(xué)研究人員用基因測序技術(shù)繪制出細(xì)菌進(jìn)化樹,這一方法有助于改進(jìn)以往的細(xì)菌分類法。

  研究成果日前發(fā)表在英國《自然·生物技術(shù)》雜志上。研究人員主要使用一種被稱為元基因組學(xué)的方法,對(duì)自然環(huán)境中的細(xì)菌樣本直接進(jìn)行測序,進(jìn)而繪制出細(xì)菌進(jìn)化樹,更好地對(duì)細(xì)菌進(jìn)行分類。

  現(xiàn)有的生物分類主要依據(jù)生物在形態(tài)結(jié)構(gòu)和生理功能等方面的特征,以弄清不同類群之間的親緣關(guān)系和進(jìn)化關(guān)系。

  研究項(xiàng)目負(fù)責(zé)人、昆士蘭大學(xué)化學(xué)和分子生物科學(xué)學(xué)院教授菲利普·胡金霍爾茨說,盡管科學(xué)界總體認(rèn)可這種根據(jù)生物進(jìn)化關(guān)系來確定的分類,但因?yàn)榧?xì)菌難以根據(jù)物理特征區(qū)分,所以此前對(duì)細(xì)菌的分類存在一些錯(cuò)誤。

  研究人員以細(xì)菌中最常見的120種基因圖譜為基礎(chǔ)繪制出龐大的細(xì)菌進(jìn)化樹,以構(gòu)建一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化的模型,修正以前的分類錯(cuò)誤。

  例如,按照原先的分類方法,只要是細(xì)胞內(nèi)部產(chǎn)生孢子的桿狀細(xì)菌都被歸入梭菌屬,而現(xiàn)在可以根據(jù)進(jìn)化樹將梭菌屬下的細(xì)菌重新分類到29個(gè)科的121個(gè)不同的屬。

  研究團(tuán)隊(duì)中負(fù)責(zé)軟件開發(fā)的博士多諾萬·帕克斯說,隨著生物測序技術(shù)的進(jìn)步,現(xiàn)在研究人員可以獲得成千上萬種細(xì)菌的完整基因“藍(lán)圖”,包括一些目前還無法在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)出的細(xì)菌。

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【糾錯(cuò)】 責(zé)任編輯: 尹世杰
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