編者按
病毒是如何起源的?科學(xué)家在研制抗擊新冠病毒的藥物中,正在進行哪些工作?針對新冠病毒研發(fā)有效的臨床救治藥物,努力提高治愈率,降低病死率,是當(dāng)前我國科研工作者應(yīng)急攻關(guān)的重中之重。2月15日,在國務(wù)院聯(lián)防聯(lián)控機制就新冠病毒藥物研發(fā)和科研攻關(guān)最新進展情況在北京舉行的新聞發(fā)布會上,科技部生物中心主任張新民介紹,藥品篩選和治療方案已取得積極進展:科技部組織全國優(yōu)秀的科研團隊,利用計算機模擬篩選、體外酶活性測試等方法對七萬多個藥品或化合物進行篩選,目前,科研攻關(guān)組已聚焦到少數(shù)幾個藥品,磷酸氯喹、倫地西韋、法匹拉韋等一批藥物先后開展臨床試驗,目前部分藥物已經(jīng)初步顯示出良好的臨床療效,本期周刊聚焦病毒的起源和藥物研發(fā)以及心理抗疫。
大部分病毒的結(jié)構(gòu)很簡單,基本上就是一個蛋白質(zhì)構(gòu)成的外殼包著一些遺傳物質(zhì),平時就與死物無異,一旦感染細(xì)胞,它們就將自己的基因注入宿主細(xì)胞當(dāng)中,利用宿主細(xì)胞復(fù)制自身產(chǎn)生新的病毒。病毒是生物嗎?它們又從何而來呢?下面,我們就來看看病毒起源的三個假說。
假說一 遠古大分子。有一些大分子,比如RNA、DNA以及蛋白質(zhì)開始或獨立或彼此協(xié)作地復(fù)制自身,這個階段可以稱為“分子生命”。然而在一片祥和的分子生命中卻產(chǎn)生了一個異類,那就是包括現(xiàn)存所有生物的最近共同祖先“露卡”(LUCA)在內(nèi)的一些分子生命,它們發(fā)展出了一個改變了生命法則的結(jié)構(gòu),那就是細(xì)胞。擁有膜結(jié)構(gòu)的細(xì)胞可以更好地保護其中嬌弱的RNA和蛋白質(zhì)等核心大分子,極大增強了這些生物的適應(yīng)力,意味著它們會把原始的分子生命摁在地上摩擦。有一種假說(The Virus-First Hypothesis)就認(rèn)為,病毒正是原始分子生命世界的“遺民”。這個假說一度十分盛行,畢竟病毒的構(gòu)造是如此簡單,乃至簡陋,它們與細(xì)胞生命的差異又是如此巨大。
有些病毒經(jīng)提純后還能形成結(jié)晶,這對于細(xì)胞生物是無法想象的。更實錘的證據(jù)來自“擬病毒”(Virusoid),它就是一個RNA分子。擬病毒沒辦法直接感染細(xì)胞,但是它可以感染病毒,確切地說是在某些病毒感染細(xì)胞的時候通過搭便車來順便復(fù)制自己、擴散自己,從而能引發(fā)一些諸如人類丁型肝炎之類的疾病。
假說二 “叛逃”的基因?;蛞材芘炎??對,在這個假說(The Progressive Hypothesis)里,基因為了讓自己流傳下去什么事情都做得出來。
細(xì)菌中廣泛存在一種名叫“質(zhì)?!保╬lasmid)的小片段環(huán)狀DNA,這些基因基本上就是一群打工仔、臨時工,細(xì)菌隨時可以從環(huán)境中吸收它們?yōu)榧核?,也隨時可以趕走它們。
在很多細(xì)菌中,除了自身原本的DNA以外,還經(jīng)常會有一些小片段的環(huán)狀DNA,那些被稱為質(zhì)粒。于是在漫長的演化中,有些質(zhì)粒學(xué)會了一件事:我們不要一輩子打工!這些質(zhì)粒從打工仔變成了二五仔,反過來把它們的細(xì)菌老板給劫持了,奪走了細(xì)菌所有的營養(yǎng)來復(fù)制自身。隨著時間推移,有些質(zhì)粒就變成了病毒。
細(xì)菌經(jīng)常會遭受一類叫作“噬菌體”的病毒感染,有些觀點認(rèn)為噬菌體來源于質(zhì)粒。而人類以及所有動物、植物的細(xì)胞和細(xì)菌很不一樣,我們都屬于“真核生物”,細(xì)胞當(dāng)中并沒有細(xì)菌那樣的質(zhì)粒,但還是有那么一些基因蠢蠢欲動。它們不肯在染色體上好好待著,而是在細(xì)胞核里左右橫跳,一會兒跑到這個染色體上,一會兒跑到那個染色體上。不過這幫調(diào)皮搗蛋的基因倒是有一個仙風(fēng)道骨的名字——轉(zhuǎn)座子(transposon)。
根據(jù)分子生物學(xué)檢測,很多轉(zhuǎn)座子都擁有和病毒非常相似的基因序列,兩者將自己整合進宿主細(xì)胞染色體的機制也高度相似。尤其是其中的“病毒樣逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子”(Retrotransposon)與某些病毒簡直相似到了令人發(fā)指的程度,唯一的不同只是這些轉(zhuǎn)座子還不能像病毒一樣在細(xì)胞之間遷移而已。
然而病毒的身世到這里卻依舊撲朔迷離,因為它們根本就不遵循一般生物的演化模式。
病毒感染的一般流程是:把自己的基因注入宿主細(xì)胞當(dāng)中,然后利用宿主細(xì)胞復(fù)制自己的基因,并且制造構(gòu)建病毒顆粒所需的各種材料,最后操控細(xì)胞將病毒顆粒的各個零件連同病毒的基因一起包裝成新的病毒顆粒,釋放出去感染別的細(xì)胞。但是在這個過程中,病毒每時每刻都在和各種生物交換基因。
比如說病毒在指揮宿主細(xì)胞包裝病毒顆粒的時候,有時候會把一些宿主細(xì)胞的DNA給一塊包進去,或者不小心在宿主細(xì)胞當(dāng)中留一點點自己的基因。哺乳動物中有一個用來阻止母體免疫系統(tǒng)攻擊胎兒的基因,就是某個病毒在一億多年前不小心落在我們細(xì)胞中的。而在病毒跨物種傳播的時候,經(jīng)常導(dǎo)致基因從一個物種轉(zhuǎn)移到另一個物種。
假說三 沉淪的細(xì)胞生物。進入21世紀(jì)以后,一系列發(fā)現(xiàn)開始讓科學(xué)家愈發(fā)意識到病毒的起源還有別的可能性。
2003年,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了一種非常不講道理的病毒——“擬菌病毒”(Mimivirus),這個病毒的體型達到了0.4到0.5微米,在顯微鏡下看都快跟細(xì)菌差不多了。引發(fā)這次疫情的冠狀病毒都被認(rèn)為是比較大的一類病毒了,體型也不到0.1微米。
2008年,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了第二種大病毒,將其命名為“媽媽病毒”(Mamavirus),從此一種又一種“大病毒”(Giant Virus)開始接二連三地出現(xiàn)在人類的視野中,到2013年發(fā)現(xiàn)的“潘多拉病毒”(Pandoravirus)更是把最大病毒的記錄刷到了1微米以上。
目前已知最大的病毒“潘多拉病毒”,它看上去和一個細(xì)菌幾乎沒什么區(qū)別。
從此,病毒與某些單細(xì)胞生物的界限開始變得模糊了起來,比如說“擬菌病毒”的結(jié)構(gòu)與基因和一類叫作“古菌”的單細(xì)胞生物非常相似,唯一的不同是,擬菌病毒丟失了一部分自主完成細(xì)胞分裂的關(guān)鍵基因,所以不得不寄生在其他生物的細(xì)胞當(dāng)中,利用宿主的細(xì)胞來生長繁殖。
于是就有了病毒起源的第三種假說(The Regressive Hypothesis),認(rèn)為病毒本質(zhì)上是墮落的生物。有些單細(xì)胞生物在長期寄生生活中,逐漸退化掉絕大部分細(xì)胞結(jié)構(gòu),最終變成了這種“活死人”一般的樣子,而像擬菌病毒之流就是剛剛開始墮落的古菌。
為什么致命病毒總是來自野生動物呢?讓我們從演化的角度分析一下。
“最好”的病毒,是既不引起太嚴(yán)重的癥狀(不然搞死了宿主自己也完蛋),但也不能太溫和(畢竟宿主身上往往同時寄生著別的病毒,搶資源的時候該下的狠手還是得下)。所以在漫長的演化中,這種博弈會促使病毒最終與宿主達成某種默契,比如說人類與可能會引起普通感冒的鼻病毒就屬于這種關(guān)系。
但是,病毒會變異,有些變異會導(dǎo)致病毒的宿主改變。病毒與新的宿主沒有長期磨合的默契,就會出現(xiàn)“下手沒輕沒重”的問題,其中有些下手特別重的就會給宿主帶來致命疾病。
在長期的演化中,人類已經(jīng)和那些從遠古祖先開始一路陪伴的病毒達成完美默契了,與從家畜那里來的病毒,比如麻疹、流感等等,磨合得還不完美,但多少有點默契,所以極少引起很嚴(yán)重的疫情。唯獨來自野生動物的病毒跟人類絲毫沒有一丁點磨合,因此引起大瘟疫的疾病幾乎全部來自野生動物。因此,希望大家平時盡量遠離野生動物,包括流浪動物,更不要去飼養(yǎng)、食用野生動物。(作者:唐騁 作者單位:中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心)