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我國(guó)科學(xué)家開(kāi)發(fā)出轉(zhuǎn)錄組快速建庫(kù)新方法 有望助力新型冠狀病毒測(cè)序
2020-02-01 15:59:46 來(lái)源: 新華網(wǎng)
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  新華社北京2月1日電(記者魏夢(mèng)佳)北京大學(xué)與清華大學(xué)聯(lián)合課題組近期在國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《美國(guó)科學(xué)院院刊》發(fā)表論文,稱(chēng)開(kāi)發(fā)出了名為“SHERRY”的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序快速建庫(kù)新方法。研究團(tuán)隊(duì)表示,這種方法大大簡(jiǎn)化了建庫(kù)過(guò)程,不僅可用于高質(zhì)量的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,對(duì)包括新型冠狀病毒等樣本的測(cè)序質(zhì)量和速度也有望顯著提升。

  核糖核酸(RNA)是存在于生物細(xì)胞以及部分病毒、類(lèi)病毒中的遺傳信息載體。目前,RNA測(cè)序技術(shù)已廣泛應(yīng)用于繪制物種轉(zhuǎn)錄組圖譜、研究疾病分子調(diào)控機(jī)制等方向。據(jù)了解,針對(duì)不同研究需求,不同起始量的RNA需采用不同的RNA擴(kuò)增方法,但目前常見(jiàn)的擴(kuò)增方法大多操作繁復(fù)、耗時(shí)長(zhǎng)。對(duì)于微量樣本的檢測(cè),也存在很多技術(shù)挑戰(zhàn)。

  研究人員發(fā)現(xiàn),被廣泛應(yīng)用于DNA測(cè)序建庫(kù)技術(shù)的Tn5轉(zhuǎn)座酶可以直接作用于RNA/DNA雜交鏈,從而省去傳統(tǒng)RNA建庫(kù)技術(shù)中的擴(kuò)增等必不可少但繁瑣的操作步驟,同時(shí)也避免了預(yù)擴(kuò)增過(guò)程中所帶來(lái)的偏向性。這種新的基于Tn5轉(zhuǎn)座酶的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序快速建庫(kù)方法,被命名為“SHERRY”。

  據(jù)作為課題組成員的北京大學(xué)黃巖誼教授和清華大學(xué)王建斌研究員介紹,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,SHERRY建庫(kù)質(zhì)量較好,對(duì)堿基序列表現(xiàn)出了較高的均衡率,且操作流程簡(jiǎn)單,整個(gè)流程僅需要5個(gè)步驟,可在一個(gè)試管中完成,時(shí)間僅約4小時(shí),其中手工操作時(shí)間不到半小時(shí),大大節(jié)省了實(shí)驗(yàn)成本。

  課題組專(zhuān)家、北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心主任謝曉亮教授表示,新方法應(yīng)用廣泛,首個(gè)臨床應(yīng)用是對(duì)新型冠狀病毒感染者的樣本進(jìn)行測(cè)序。與現(xiàn)有的RNA測(cè)序建庫(kù)方法相比,“SHERRY”更靈敏、更簡(jiǎn)單,這對(duì)檢測(cè)和分析十分重要。

  “我們的團(tuán)隊(duì)目前正在夜以繼日、爭(zhēng)分奪秒地攻關(guān),希望提供更好的新型冠狀病毒的測(cè)序方法,服務(wù)疫情防控需要?!敝x曉亮說(shuō)。

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【糾錯(cuò)】 責(zé)任編輯: 王佳寧
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